日本の植生は、多様性に富んでいます。北海道および本州、四国の高地では、モミ、トウヒ、マツなどによる針葉樹混交林(日亜高山帯森林あるいは亜寒帯森林)が生育し、南の地域では、亜熱帯性常緑広葉樹林やマングローブの湿地帯が見られます。
日本の屋久島は、マングローブ生育の北限です。本州と四国では、高い山の頂上付近に高山植物が生育していることが多く、亜高山帯植生や天然のブナ林も小規模ですがこの山岳地帯全域に分布していて、ここが生育地のほぼ南限になっています。高山植物は、北海道の数カ所で、海抜約0mの場所に生育しているほか、多くの山の頂上やその付近、さらに、活動中の噴火口がある所では、比較的標高の低い山でも見られます。噴火口周辺の土は、独特の植生を作り出し、このような場所では、酸性度の低い土を好む植物が多く育ちます。
北海道の渡島半島の北部には主に、トドマツ、エゾマツ、アカエゾマツなどがダケカンバと混生して生育しています。ブナが見られるため、ここが亜寒帯と冷温帯の境界であることがわかります。本州で針葉樹林が見られるのは、日本アルプスなどの大体1,600mから2,500mの間の山々に限られています。
しかし、木の種類は北海道よりも豊富で、例えば、コメツガ、シラビソ、オオシラビソ、ヤツガタケトウヒ、ヒメバラモミなどさまざまです。
またこの地域では、ひときわ目立つダケカンバの単一林もよく見かけられます。本州は、北から南まで高い山が縦断して東西を分けているため、すべての標高で、太平洋側と日本海側の植生には明らかな違いが見られます。日本海に面した山の西側は冬には降雪による多量の降水があります。場所によっては10mもの積雪に覆われるので、日本海側の植物は、豪雪に耐えられるものになっており、晴れて乾燥し、雪がほとんど降らない太平洋側で育ったものとは、種またはそれ以下のレベルにおいて、違いがあります。
本州にはほかにも、数少ない針葉樹の単一の原生林があります。青森県北部のアスナロ林、秋田県のスギ林、長野県南西部のヒノキ林、和歌山県高野山のコウヤマキ林などです。これらの森林は、所有者である一族や神社や寺が伐採から守ったために保存されたものです。落葉樹はたいてい切り倒されましたが、針葉樹は保護されたため、時を経てこれらの森林は、単一林となっています。
針葉樹林の南に広がるのは、冷温帯落葉広葉樹林です。主に、ブナとミズナラ(通称オーク)の混交林で、下草のササが密生しています。本州の太平洋側では、ウラジロモミが、ブナ属の木やモミと混生していることが多いのですが、時には、ブナ林に隣接して単一林を形成していることもあります。日本海側では、常緑広葉樹林がブナ林と隣りあい、ササがブナ林の下草であるが、太平洋側のササとは種が異なります。
ブナ林には、ほかにもさまざまな木が混生しています。その中には、カエデ属、シナノキ属、トネリコ属、サクラ属、モクレン属、ハリギリ属、ナナカマド属などにつながる下位種があり、さらに雨の多い場所では、トチノキ属、カツラ属、フサザクラ属、ミヤマハンノキなどが見られます。
ブナ林の南には暖帯広葉樹林が広がり、主に多種多様なブナ科の木(ブナやオークの仲間)で構成されています。ナラ属、シイノキ属、マテバシイ属のいくつかの種や、クスノキ科、ツバキ科の仲間が、その他多種多様な常緑樹、落葉樹の木々と混生しています。
暖帯植生は、常緑広葉樹とさらに南方の類縁植物を特徴とし、本州の中央部から四国、九州およびそれ以南に広がります。北方では、このタイプの植生は、ほとんど海岸に直接面した地域に限定されますが、南下するにつれて内陸の方に広がっていきます。
典型的な暖帯性常緑広葉樹は、オークの下位のアカガシ亜属、マテバシイ属、シイノキ属、ニッケイ属、タブノキ属、ツバキ属、サカキ属などの下位のさまざまな種です。これらの木が混生していることから、この地域が、東南アジアに圧倒的に多いブナ科・クスノキ科・ツバキ科の混交林の北限であることがわかります。これらの混交林は、本州の太平洋側・日本海側いずれにおいても北緯38度まで達し、それより北は温帯性落葉広葉樹林に変わっていきます。
Photo:©Ogasawara Village Tourist Association
日本の南方海上に浮かぶ亜熱帯の群島は、本土とは異なる動物相、植物相を持っていて、その中には、固有種が多数含まれます。
伊豆諸島、小笠原群島(別名:ボニン諸島)、火山列島(別名:硫黄列島)は30以上の火山島から成り、東京の南方、太平洋上に連なっています。伊豆諸島の北端は大島で、最も海抜の高い場所は854m、南端は鳥島に至ります。小笠原群島は、聟島列島、父島列島、母島列島の3つから成り、最も大きい父島でも、24 km2です。
小笠原群島の地形は変化に富んでいます。最北の島々は、大部分の土地は切り開かれていますが、南方のもっと近づきにくい訪れづらい島々には、一次林がまだ所々に残っています。母島の大半と父島の一部分、そしていくつかの小さい島々は、常緑広葉樹林に覆われていますが、ほとんどが二次林で、原生林は、もっと奥の近寄れない場所にあります。火山列島は3島から成り、その中の硫黄島は、海中に沈んだカルデラによって形成された島で、第2次世界大戦で戦場になった場所として広く知られています。
Photo:©CI/Yasu Hibi
南西諸島は、九州南方の屋久島から台湾の東方約200kmの西表島まで、100を超える島々から成り、薩南諸島(大隈諸島、トカラ列島、奄美諸島など)と、琉球諸島(沖縄諸島、先島諸島など)の2つのグループに分けられます。北方の島々は、植生という点からみると温帯に近く、奄美諸島の南の植物相は亜熱帯寄りです。
沖縄諸島の中の沖縄本島は、南西諸島では最大の島で、1,200 km2の面積を持ち、天然林の占める割合が北海道を除くと日本全国で最大です。西表島と沖縄北部もとりわけ広い常緑広葉樹林に恵まれています。琉球諸島のマングローブやサンゴ礁といった生態系は、日本の他の地域では、めったに見られないものです。このように、南西諸島は、東洋的な動物相を持つ地域であると同時に、旧北亜区の南限でもあるので、これらの島々は、それぞれの固有種だけでなく、2つの地域の動物相を併せ持っています。